分子动力学模拟抽的帧如何转化成轨迹文件

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1、将每一帧的数据,如原子坐标、速度、加速度等信息,保存在一个单独的文件中。

2、按照一定的时间间隔,将这些文件按照时间顺序排列,形成一个连续的时间序列。

3、将这个时间序列保存为一个轨迹文件,可以选择多种格式,如xyz、pdb、mol2等,具体取决于所使用的软件和应用场景。

分子动力学模拟抽的帧如何转化成轨迹文件